Kolumny o długości 1,5…4,8 m napełnia się frakcją nośnika o rozdrobnieniu 100…120 mesh, kolumny o długości 15 m frakcją 100 mesh. Kolumny dłuższe napełnia się jeszcze bardziej rozdrobnionymi frakcjami nośnika. Faza ciekła musi być naniesiona na nośnik w odpowiednim dla niej rozpuszczalniku. Podczas analizy mieszaniny metylo- i propylooctanów w dwóch kolumnach o jednakowej długości (z których jedna była wypełniona 12,5°/o fazy ciekłej naniesionej na nośnik wg tradycyjnych zaleceń, a druga mieszaniną równych proporcji: 7,5%, 10%, 12,5% i 17,5% fazy ciekłej na nośniku), Scott stwierdził, że efektywność rozdziału była jednakowa. Optymalne ilości fazy stacjonarnej na nośniku zależą od radzaju i ciężaru cząsteczkowego analizowanego związku, ale nie przekraczają 5…15°/o. W przypadku rozdzielania substancji różnych grupowo, różniących się ciężarem cząsteczkowym i podatnością, gdy rozdziały prowadzone są z programem temperatury, przyjmuje się jako optymalne 10°/o wagowo fazy ciekłej na nośniku.
